DNA采血卡片:药物遗传学研究中DNA产量和质量的决定因素(3)
DNA采血卡片:药物遗传学研究中DNA产量和质量的决定因素(3)
样本收集:为规范比较,不直接从指尖穿刺采集血斑。相反,一滴10毫升的血液(通过静脉穿刺收集)被放置在指尖进行血斑检查。每个DNA采血卡上收集4滴(每滴10微升)。采用乙二胺四乙酸(EDTA)(乙二胺四乙酸(EDTA然后,我们取不同浓度的10毫升,在相应的卡片上用EDTA来获取血斑,使用两种类型的DNA采血卡(等码卡)执行了相同的协议。®或FTA经典卡®)当卡片装满后,这些水滴会在室温下一夜干燥,并储存在装有干燥剂包的密封塑料袋中,以避免潮湿,并保护它们不受光线的影响。每位志愿者填写了几张DNA卡,以便在不同温度(室温、-20°C和-80°C)和不同时间(1周、2个月和1年)进行观察,在不同标准条件得室温下保存两个月,不含EDTA。
DNA洗脱等码卡®DNA是通过修改制造商的指令来提取的。使用纸打孔机,将0.125英寸(3.2mm)圆盘从含有干血的完整卡片基体区域打孔。在连续使用期间,打孔机先用酒精和火焰进行消毒,然后再通过干净的滤纸进行几次冲孔。将3个含干血的圆盘放入1.5毫升的试管中,在80℃的烤箱中加热20分钟。为了去除污染物,圆盘用500毫升的水洗了两次,漩涡三次,持续5秒。清洗盘被转移到一个新的管和增加40升的水。冷冻保存前,在100°C下孵育15 min。从卡片矩阵中提取DNA。脉冲涡旋60次左右,离心1 min.13,000×g。用塑料钳取出基质盘,并将其挤压在管子的一侧以去除多余的水分,洗脱DNA上清液保存于-20°C,经干燥和室温保存后再分离:我们将已经分离的3.2mm光盘烘干,再进行新的分离。
FTA经典卡®. 三个3.2毫米光盘是使用相同的协议获得的等码卡。®。DNA是根据制造商的指示提取的,并作了一些修改。将3个含干血的圆盘放入1.5毫升的试管中,在80℃的烤箱中加热15-20分钟。在每种FTA纯化试剂200μl中进行三次洗涤,在室温下孵育5 min。在TE-1缓冲液(10 mm Tris-HCl,0.1mm EDTA,pH8.0)中进行两次洗涤,然后在室温下干燥1小时或10 min。在60°C下,加入102l的pH13溶液(0.1NNaOH,0.3mEDTA),孵育5 min。随后加入198μl的pH7溶液(0.1M-Tris-HCl),多次倒置管,使圆片保持在溶液中。样品经过5 min的涡旋处理。然后在室温下离开10分钟。将上清液转移到新的无菌管中,在-20°C下保存,干燥后在室温下保存,进行再分离。
DNA定量含有纯化的单链dna(Ssdna)的单链dna(Ssdna)。®和FTA经典卡®在-80°C下定量保存,直至使用。使用光谱荧光仪(以日立牌机器为例),按OligreenssDNA定量试剂盒(分子探针,Invitrogen,Carlsbad,CA,USA)测定ssDNA产量。
血红蛋白浓度血红蛋白是从血液中纯化的DNA样品中的主要污染物,被用作评价纯化方案的标记物。每个DNA样本被稀释(1/10),用分光度计(Cecil 2100,Tovatech,South Orange,NJ,USA)在405 nm处读取吸光度。
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